Plusieurs associations sont nées, au fil des décennies, des activités nombreuses et diverses du Centre Missionnaire. Parmi les plus récentes, l’Association Familiale Protestante ; l’Association des Amis du Protestantisme en Bretagne Centrale –  respectivement constituées en 2004 et 2002 – et l’Action Internationale du Centre Missionnaire, créée en 2012, tenaient récemment leurs assemblées générales, temps traditionnels de bilan et de prospective, mais également moments d’information et d’échanges conviviaux.